区块链技术的特性非常适合用于追踪产品来源和供应链管理。目前，全球制药行业正在积极探索区块链技术，以帮助解决几个现存难题，而且已开发出几个具有概念验证及应用案例，可区分如以下5大应用案例。
 
应用一：验证返回药物的真实性
在制药行业，药物经常被退回给药品制造商。例如，批发商将订购的过剩库存退回给药品制造商。然而，制药公司在转售这些退回的药物之前，有法律义务验证退回药物的真实性。但这对后勤作业上是一项很大负担，因此，药品制造商利用区块链的分布式帐本来记录其药品包装的序号，使批发商和客户可以通过网路连接到区块链来验证药品包装的真实性。
 
默克与SAP合作推出SAP Pharma POC区块链应用程序APP，也就是ATTP药品先进跟踪和追踪解决方案，为药品包装时产生唯一标识代号。当制造商发货前须先在SAP Pharma POC区块链上注册该项目，并从ATTP产生四项信息：项目编号（基于GS1标准）、序列号、批号和到期日期，以供经销商行动装置APP扫描提取该四项信息，便于验证退货。因此，可以避免伪造的条码副本，每次包装易手时都具有追踪功能，同时可从APP的地图追踪药品位于地理区域。
 
应用二：防止假冒药品和医疗器材
假冒问题不仅限于药品制造商，还延伸到医疗器械制造商。据世界卫生组织估计，现今流通的医疗器材中有8％是冒牌货。假冒药品和医疗器材对消费者构成重大风险，同时也造成合法制造商的损失。
 
诺华公司正在开发欧洲制药业与欧盟之间的区块链医疗保健网络(IMI)，尝试使用区块链来识别假冒药品，并使用区块链和物联网实时查看供应链中所有参与者的可见度，包括区块链中小企业公司、大学、临床实验室、医院、患者代表和其他人。
 
应用三：制药供应链的合规性
医药供应链中的环境条件可能直接影响药物的质量和功效，因此供应链的每个参与者(制造商、物流公司、商店和药房等)必须遵守相关规定，利用智能物联网设备监控整个供应链中的药物，并且在整个供应链生命周期中使用智能设备记录温度，湿度和其他因素。同时，智能合约可以在区块链中进行自动调整，将物流公司的储存条件不合规定的程度进行支付扣款动作。
 
应用四：临床试验同意书签署的透明性和可追溯性
当患者同意参与临床试验过程中的每个步骤，临床试验同意书可能须机构审核、批准、有效签署，还有可能进行版本修订、需对患者或利益相关者透明并且可追踪及可追溯等等。区块链提供了一种机制，对同意书进行以安全、可公开验证的方式储存、跟踪及实时共享。另外，智能合约可以绑定到协议修订，使得临床试验协议内容的任何增减的更新，都需要取得患者同意。因此，在医药大厂的商业模式与参与者分润等机制确立，将吸引民众授权参与研究，可望加速新药研发速度。
 
应用五：还历于民及提高临床试验数据的质量和可靠性
临床试验数据具安全、不可窜改和可公开验证的方式储存在区块链中，可提高临床试验数据的可靠性。而且患者藉由区块链可以储存和控制自己的医疗数据的使用程度。
 
辉瑞、安进和赛诺菲目前正合作利用区块链技术，应用于安全储存患者健康数据，以加速临床试验，最终降低药物开发成本。还有，区块链医药新创公司Exochain于区块链上建立患者健康信息的安全储存管理机制，允许患者自己控制临床试验如何与他们的医疗数据进行交互使用，这将会提高临床试验患者的参与的意愿，同时使个人能够精准控制自己医疗资料。